发证部门充分相信申请单位，对申请重在形式审核。
一是审查申请材料的完整性和规范性。
二是审核项目是否符合政策。按照应发尽发的要求，只要符合产业政策，都要发证。首先看项目建设地，不能是位于法律法规规定禁止建设区域内的; 其次看产业政策，不能是国家明令淘汰或者立即淘汰的落后生产工艺装备、落后产品的;最后看环保要求， 必须依法取得建设项目环境影响评价文件审批意见， 或者按照有关规定经地方人民政府依法处理、整顿规范并符合要求，对于新建、改建、扩建项目排污单位， 如果通过等量或减量替代削减获得总量控制指标的， 出让单位需要完成排污许可证变更。
三是审核排污有关许可事项，审相关证明。
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